- 生体機能・構造医学専攻
- 統合解剖学
- 分子腫瘍学
- 機能組織学
- 細胞生化学
- 細胞生理学
- 脳神経生理学
- 消化器外科学
- 呼吸器・小児外科学
- 腎・泌尿器科学
- 心臓血管外科学
- 乳腺外科学
- 小児泌尿器科学
- 視覚科学
- 耳鼻咽喉・頭頸部外科学
- 加齢・環境皮膚科学
- 口腔外科学
- 形成外科学
- 生体情報・機能制御医学専攻
- 実験病態病理学
- 臨床病態病理学
- 薬理学
- 細菌学
- 免疫学
- ウイルス学
- 病態モデル医学
- 整形外科学
- リハビリテーション医学
- 精神・認知・行動医学
- 精神腫瘍学(連携大学院)
- 脳神経外科学
- 運動器スポーツ先進医学（寄附講座）
- こころの発達医学（寄附講座）
- 運動器健康増進医学（寄附講座）
- 産科婦人科学
- 新生児・小児医学
- 生体防御・ハントカジノ 出金医学専攻
- 認知症科学
- 腫瘍・神経生物学
- 神経発達症遺伝学
- 神経毒性学
- 神経発達・再生医学
- 認知機能病態学(寄附講座)
- 消化器・代謝内科学
- 呼吸器・免疫アレルギー内科学
- 循環器内科学
- 腎臓内科学
- 神経内科学
- 血液・腫瘍内科学
- 麻酔科学・集中治療医学
- 放射線医学
- 感染制御機能学(連携大学院)
- 肝炎・免疫学(連携大学院)
- ハントカジノ 出金診療医学・ハントカジノ 出金内科学
- 地域医療学(寄附講座)
- 地域包括医療学(寄附講座)
- 臨床薬剤学
- 先進急性期医療学
- 救命救急医療学
- 予防・社会医学専攻
- 環境労働衛生学
- 公衆衛生学
- 法医学
- 医学・医療情報管理学
- 医学・医療教育学
- 次世代医療開発学
- 臨床医療デザイン学
- 医療安全管理学
- 次世代医療探索学
- 臨床感染制御学
- 医療政策・経営科学
- 病院経営学
- 医療統計学・データサイエンス
- 医療人育成学（寄附講座）
- 病院中央部門
- 中央臨床検査部
- 中央手術部
- リハビリテーション部
- 中央放射線部
- 集中治療部
- 周産期母子医療センター
- 人工透析部
- 内視鏡医療センター
- 病理診断部
- 救命救急センター
- 救急科
- 急性心臓疾患治療部
- 臨床遺伝医療部
- 臨床腫瘍部
- 緩和ケアセンター
- 睡眠医療センター
- 輸血・細胞療法部
- いたみセンター
- 地域包括ケア推進・ハントカジノ 出金センター
- 地域医療連携センター
- 感染制御部
- 臨床ハントカジノ 出金開発支援センター
- 診療情報管理部
- 医療デザインハントカジノ 出金センター
- 地域医療教育ハントカジノ 出金センター
- 付属施設・公開利用施設
- 共同ハントカジノ 出金教育センター
- 実験動物ハントカジノ 出金教育センター
- RI(アイソトープ)ハントカジノ 出金施設
- エコチル調査愛知ユニットセンター
- 不育症ハントカジノ 出金センター
- 脳神経科学ハントカジノ 出金所
- 感染症学
- 臨床感染症学（寄附講座）
